Идея создания музея связана с многочисленными археологическими находками на Охтинском мысе, которые в настоящее время хранятся в разных местах, включая Эрмитаж. Исследования почвы Меншикова бастиона показали, что древесина конструкций имеет возраст более 500 лет.
Концепцию будущего музея разработало архитектурное бюро «Студия 44» . Проект включает создание выставочных залов, лектория, открытого фондохранилища и административного блока. Планируется музеефицировать часть исторического вала бастиона и организовать демонстрацию археологических находок Петровской эпохи.
